有关墨西哥柏原产地病虫害报道很少，引种在世界各地的墨西哥柏主要病害为溃疡病，在西班牙发现引起墨西哥柏死亡的一种真菌也会造成枝干溃疡，并引起树皮甲虫危害。防治方法为去除感染枝条和施用杀菌剂。此外，影响墨西哥桕的害虫尚有柏蚜，它的危害也常和真菌危害相伴发生。
国内引种的墨西哥柏在江西发现有溃瘍病，但危害不严重。四川等地发现有赤枯病，主要靠风雨传播，广东发现叶枯病，云南还没有报道。上述病害的主要诱发原因为高温日灼、排水不良、土壤黏重。感病植株以1年生最重，随年龄增加病情减轻，6年生以上一般不再感病，坡地混交林感病率低于平地纯林。根据对真菌病害发生规律和墨西哥柏发病条件的研究，对上述病害的防治应采取综合防治的方针。以良种壮苗，适地适树，合理混交，适时抚育等营林措施为主，辅以化学防治。可采用70%托布津1000倍加50%代森铵1000倍混合液，或40%灭菌丹500倍加50%多菌灵500倍混合液以及5波美度石硫合剂进行喷洒防治，每7天左右1次，防治效果较好。
